Hola! A mi me paso lo de los puntos en un 10 litros que tengo con dos anubia, en mi caso al ser pocos litros me fue fácil, yo lo que hice fue sacarlas y limpiarlas a conciencia con mucho cuidado, y reinicie de nuevo el acuario con agua que tenía de otro acuario y le baje las horas de luz, y solucionado
Yo empezaría buscando el motivo. Demasiada luz o demasiadas horas de luz, desequilibrio NPK como dice Oscar. Poco mantenimiento.
Cuentanos mas. Luz, cambios de agua, Cuanto tiempo está la luz encendida, Tamaño del acuario, filtración. Habitantes...